La compagnie a été créée en 1900 par la famille Schepers qui a commencé ses activités par la navigation fluviale sur l'Ems, étendues ensuite sur la Weser et sur l'Elbe. Dans le milieu des années 1950, la flotte s'est agrandie avec l'arrivée de caboteurs qui seront exploités sur la mer du Nord et la mer Baltique. Le capitaine Rudolf Schepers reprenait la compagnie de son père Tim dans les années 1970. La tradition de la compagnie familiale est perpétuée par le fils et la fille de Rudolf Schepers, Jan et Katrin.
La compagnie Rudolf Schepers exploite douze porte-conteneurs et deux vraquiers en janvier 2019

KATHARINA S. (ici sous le nom de APL VENEZUELA) Construit en 2001 en Pologne.
Long: 220 m. Larg: 32,60 m. 3 100 TEU . Vitesse: 22,3 nds.
 
 
BERNHARD S . Construit en 1995. Long: 149,60 m. larg: 23,10 m. Capacité de 1 104 TEU. Vitesse: 19,5 nds
 
KARIN S . Long: 163,29 m. Larg: 27,50 m. Capacité de 1 640 TEU. Vitesse: 17,5 nds.
 
LAURA S . Construit en 1998. Long: 207,40 m. Larg: 29,80 m. Capacité de 2 474 TEU. Vitesse: 21 nds
 
LOUIS S . Construit en 2003. Long: 220 m. Larg: 32,60 m. Capacité de 3 100 TEU. Vitesse: 22,3 nds.
 
JAN S. (ici sous le nom de MORECAMBE BAY) Construit en 1996. Long: 178,09 m. Larg: 27,50 m. Capacité de 1 906 TEU. Vitesse: 20 nds.
 
THEA S. (ici sous le nom de SAFMARINE KEI). Construit en 2002. Long: 207,40 m. Larg: 29,80 m. 2 474 TEU. Vitesse: 22 nds
 
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