Le 14 mars 1869, les eaux de la Méditerranée sont introduites dans les Lacs Amers et, le 15 août 1869, la jonction des deux mers est effective. Lesseps proclame à cette occasion : « Au nom de son Altesse Mohammed Saïd, je commande que les eaux de la Méditerranée soient introduites dans le Lac de Timsah, par la grâce de Dieu !».

L'inauguration a lieu du 17 au 20 novembre 1869, pure féérie orientale. Une réception grandiose est donnée par le Khédive à ses hôtes de marque, comme l'épouse de Napoléon III — l'impératrice Eugénie (le hasard de la vie fait que Ferdinand de Lesseps l'avait rencontrée toute jeune chez sa cousine la Comtesse de Montijo, et des liens d'amitié durables unirent Eugénie à Ferdinand, lequel, à plusieurs occasions, eut recours à elle pour se concilier la faveur de l'Empereur) — l'Empereur d'Autriche François-Joseph, le Prince de Galles et bien d'autres souverains, mais aussi nombre d'invités parmi les hommes de lettres ou de sciences (Théophile Gautier, Emile Zola, Henrik Ibsen, etc.). Quatre-vingt bâtiments, dont cinquante de guerre, partis de Port-Saïd, traversent le canal, équipages sur les vergues et pavois battant au vent, une véritable revue navale. Ils débouchent en Mer Rouge le 20 novembre.